Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms