Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ARL2-SNX15V9GYD0 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ARL2-SNX15V9GYD0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ARL2-SNX15V9GYD0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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