Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms