Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RABGEF1Q9UJ41 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RABGEF1Q9UJ41 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RABGEF1Q9UJ41 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RABGEF1Q9UJ41 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RABGEF1Q9UJ41 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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