Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms