Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms