Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms