Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms