Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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