Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms