Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYLDQ9NQC7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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