Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms