Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLMQ9NP87 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms