Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG4Q9H9E3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms