Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms