Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms