Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms