Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms