Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms