Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRTQ9BXP5 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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