Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms