Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS8Q99627 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS8Q99627 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COPS8Q99627 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS8Q99627 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COPS8Q99627 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS8Q99627 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COPS8Q99627 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS8Q99627 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS8Q99627 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COPS8Q99627 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS8Q99627 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COPS8Q99627 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COPS8Q99627 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS8Q99627 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS8Q99627 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COPS8Q99627 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COPS8Q99627 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COPS8Q99627 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COPS8Q99627 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms