Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms