Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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