Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms