Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms