Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms