Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM41Q8WV44 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms