Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTD1Q8N815 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms