Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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HDDC3Q8N4P3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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