Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC83Q8IWF9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC83Q8IWF9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms