Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms