Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L1Q676U5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms