Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PRAMEF20Q5VT98 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PRAMEF20Q5VT98 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PRAMEF20Q5VT98 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PRAMEF20Q5VT98 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PRAMEF20Q5VT98 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PRAMEF20Q5VT98 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PRAMEF20Q5VT98 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PRAMEF20Q5VT98 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRAMEF20Q5VT98 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PRAMEF20Q5VT98 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PRAMEF20Q5VT98 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRAMEF20Q5VT98 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRAMEF20Q5VT98 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRAMEF20Q5VT98 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRAMEF20Q5VT98 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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