Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms