Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms