Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC153Q494R4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms