Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

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Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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CHD9Q3L8U1 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHD9Q3L8U1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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