Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SGCAQ16586 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SGCAQ16586 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SGCAQ16586 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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