Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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DDB1Q16531 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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DDB1Q16531 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DDB1Q16531 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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