Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms