Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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