Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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SYCP1Q15431 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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SYCP1Q15431 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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SYCP1Q15431 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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SYCP1Q15431 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCP1Q15431 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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