Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARHGEF6Q15052 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms