Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms