Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SSPNQ14714 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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