Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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