Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ERV3-1Q14264 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms