Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms