Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms